Một ngày nọ ở Mikado City (三門市, Mikado-shi?) (với 280 000 cư dân), một "cánh cổng" đến một thế giới khác đột nhiên được mở ra. Quái vật được đặt tên là "Neighbors" (近界民（ネイバー）, Neibā, lit. "Near-world people"?) 界 民 ( イ バ ) , Neibā, mang nghĩa "Cư dân thế giới liền kề") bắt đầu xuất hiện từ cánh cổng này. Lúc đầu loài người bị choáng ngợp khi phát hiện vũ khí của họ vô tác dụng đối với những Neighbors, cho đến khi một tổ chức bí ẩn có thể đẩy lùi các cuộc tấn công của Neighbors xuất hiện. Tổ chức này được gọi là Cơ quan Quốc phòng, hay "Border" (Biên Giới), và đã chiếm đoạt được công nghệ của Neighbor là những "Triggers", cho phép người dùng truyền dẫn Trion, năng lượng bên trong bản thân, và sử dụng nó làm vũ khí hoặc cho những mục đích khác. Bằng cách kích hoạt một Trigger, cơ thể của người dùng được thay thế bằng một cơ thể chiến đấu mạnh hơn và có khả năng chống chịu cao hơn được làm bằng trion. Các thành viên của Border được chia thành ba cấp, A, B và C, chỉ một vài thành viên hạng A sở hữu những Triggers đặc biệt, với sức mạnh có thể sánh ngang những Triggers của Neighbors.

Bốn năm sau khi cánh cổng được mở, người dân ở thành phố Mikado đã quen với những trận chiến với Neighbors, và ít nhiều đã trở lại với cuộc sống hàng ngày của họ. Border đã trở nên nổi tiếng. Một ngày nọ, một học sinh tóc trắng bí ẩn tên là Yūma Kuga (空閑 遊真, Kuga Yūma?) chuyển đến một ngôi trường ở thành phố này. Kuga thực tế là một Neighbors mạnh mẽ với hình dạng con người, một sự thật mà Kuga muốn giấu khỏi Border. Trong trường, Kuga gặp một học sinh khác, Osamu Mikumo (三雲 修, Mikumo Osamu?), người thực ra là một thực tập sinh hạng C ở Border. Vì Kuga hoàn toàn không biết gì về cuộc sống ở thành phố Mikado, trách nhiệm hướng dẫn Kuga rơi vào vai Mikudo, đồng thời với trách nhiệm ngăn không cho bí mật của Kuga bị Border phát hiện ra.